1.江宁校区创新创业小镇：成立于2016年，占地面积2000m²，提供创业工位76个，是江苏省创业示范基地、南京市众创空间、南京市大学生创业园。由河海大学投资建设，江苏河海大学资产经营有限公司负责经营和管理，用于支持河海大学学生创新创业教育和实践的载体。

2.江宁校区雅学楼创客空间：成立于2016年，占地面积800m²，提供创新工位48个，是大学生创新训练计划重点创新团队创业孵化场地。

3.常州校区59号楼创新创业基地：建成于2023年，占地面积4500m²，提供独立创业空间32个，提供工作工位300余个，配备路演厅、讨论室等共享空间，为各入驻团队共充足的办公空间和丰富的项目培育孵化服务。